Organisatorisch sind an der Staatlichen Wirtschaftsschule Deggendorf derzeit folgende Fachbereiche eingerichtet:

  1. Fachbereich Wirtschaft
  2. Fachbereich Übungsunternehmen
  3. Fachbereich Informationsverarbeitung und Digitales Leben und Arbeiten
  4. Fachbereich Deutsch
  5. Fachbereich Religion
  6. Fachbereich Englisch
  7. Fachbereich Mathematik
  8. Fachbereich Geschichte sowie Politik und Gesellschaft (G/PuG) - vormals Geschichte/Sozialkunde (GSk)